Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PfasQ5SUR0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PfasQ5SUR0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PfasQ5SUR0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms