Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ttf2Q5NC05 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms