Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srrm1Q52KI8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm1Q52KI8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms