Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx25Q3ZT31 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx25Q3ZT31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snx25Q3ZT31 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms