Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckap2Q3V1H1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ckap2Q3V1H1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckap2Q3V1H1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms