Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl5Q3UTQ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms