Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fchsd2Q3USJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fchsd2Q3USJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fchsd2Q3USJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms