Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf48Q3US17 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Znf48Q3US17 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf48Q3US17 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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