Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Edc4Q3UJB9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Edc4Q3UJB9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms