Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Greb1Q3UHK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Greb1Q3UHK3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms