Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Frmd8Q3UFK8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Frmd8Q3UFK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms