Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Yipf3Q3UDR8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms