Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hace1Q3U0D9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hace1Q3U0D9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms