Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf3c3Q3TMP1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms