Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdlim7Q3TJD7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdlim7Q3TJD7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdlim7Q3TJD7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms