Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam107bQ3TGF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam107bQ3TGF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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