Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Riiad1Q3KNY5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms