Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp1aQ2LKU9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms