Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fam171bQ14CH0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam171bQ14CH0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam171bQ14CH0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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