Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Perm1Q149B8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Perm1Q149B8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Perm1Q149B8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Perm1Q149B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Perm1Q149B8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
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Perm1Q149B8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms