Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
1700061G19RikQ08EE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms