Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col9a2Q07643 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col9a2Q07643 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col9a2Q07643 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms