Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nfe2Q07279 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms