Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gdf3Q07104 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gdf3Q07104 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gdf3Q07104 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms