Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah1bQ06985 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah1bQ06985 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms