Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp2Q06649 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp2Q06649 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sh3bp2Q06649 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms