Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrx2Q06348 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrx2Q06348 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms