Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprgQ05909 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprgQ05909 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprgQ05909 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms