Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Emx2Q04744 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Emx2Q04744 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Emx2Q04744 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms