Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnb1Q03717 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Kcnb1Q03717 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kcnb1Q03717 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms