Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp39Q02525 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp39Q02525 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms