Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec23aQ01405 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec23aQ01405 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec23aQ01405 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms