Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pax8Q00288 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms