Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cds1P98191 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds1P98191 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cds1P98191 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds1P98191 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cds1P98191 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms