Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhodP97348 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhodP97348 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RhodP97348 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhodP97348 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhodP97348 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RhodP97348 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhodP97348 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RhodP97348 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RhodP97348 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RhodP97348 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms