Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubg1P83887 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubg1P83887 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms