Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgdrP70263 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtgdrP70263 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtgdrP70263 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms