Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps29P62274 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms