Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxbp1P58501 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms