Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtnsP57757 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtnsP57757 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms