Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf5P56477 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms