Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gp1bbP56400 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms