Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PklrP53657 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PklrP53657 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PklrP53657 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PklrP53657 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PklrP53657 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PklrP53657 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PklrP53657 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PklrP53657 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PklrP53657 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PklrP53657 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PklrP53657 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PklrP53657 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PklrP53657 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PklrP53657 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PklrP53657 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PklrP53657 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PklrP53657 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PklrP53657 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PklrP53657 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PklrP53657 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PklrP53657 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PklrP53657 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms