Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2e1P52482 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2e1P52482 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms