Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LumP51885 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LumP51885 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LumP51885 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LumP51885 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LumP51885 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LumP51885 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LumP51885 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LumP51885 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LumP51885 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LumP51885 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LumP51885 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LumP51885 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms