Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn1swP51491 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1swP51491 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms