Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc13P50207 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc13P50207 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc13P50207 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms