Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl13P47963 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl13P47963 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms