Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl5P47962 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms