Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr2f2P43135 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2f2P43135 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms